在藻類生物中，藍綠藻是簡單、原始的單細胞生物，沒有細胞核，通常呈顆粒狀或網狀，色素均勻分布在細胞質中。在溫度高，光照較好，水溫25-35℃時，藍綠藻生長迅速，比其他藻類生長快。藍綠藻繁殖很快，2-3天就能填滿整個池塘。夜間水中的溶解氧會被藍綠藻大量消耗。如果天氣突然變化，藻類會因氧氣不足而大量死亡。當藍綠藻死亡時，會產生大量的羥胺、硫化氫等有毒有害物質，這些物質在水中積聚多了，就會導致魚類中毒死亡。藍綠藻中的項圈藻能迅速產生致死因子藍藻素，破壞養殖對象的鰓組織，干擾其新陳代謝的正常進行，麻痹神經，使其死亡。養殖水體富營養化，藍綠藻更容易生長，不能換水的池塘往往更容易發生藍綠藻爆發。有機磷是藍綠藻生長的必要因素。控制藍綠藻基本的方法是去除有機磷。可以在全池每畝撒10公斤沸石粉，平衡氮磷比例。

藍綠藻防治的四個注意點：

1、常規清塘。長出藍綠藻的池塘，待池塘曬干后，每畝用生石灰100公斤灑滿整個池塘，可有效抑制藍綠藻的繁殖。

2、調控水質。微生物制劑常用于調水，如EM菌、芽孢桿菌、小球藻等，使有益藻類得到大量繁殖，培育綠藻、硅藻等有益藻類迅速生長成優勢藻種，抑制藍綠藻的生長。只要“藻相”平衡，有害藻類就不會大量繁殖。在使用微生物制劑過程中，應注意防止池塘缺氧。應在連續晴好天氣下使用，使用后并開啟增氧機兩小時以上。

3、科學投餌。當養殖對象進入采食生長旺季時，大量投餌會使水體中的殘餌和養殖對象的排泄物增多，使水體富營養化，有藍綠藻的池塘這時就很容易爆發，對水質的管理和病害防治帶來困難。要根據天氣和進食情況進行合理投喂，經常調整投喂量，盡量避免餌料過多。通過使用底質改性藥物改善底質，并調控水質。

4、藥物控制。對于出現藍綠藻的池塘，最好使用生物藥物進行防治。不能全池使用化學性銅類藥物，因為化學性藥物會將有益藻類、有害藻類全部殺滅，形成“倒藻”，引起缺氧浮頭，而且使底質惡化，引發應激中毒。可在下風邊藍藻聚集處局部使用強氯精等藥物殺滅，再用解毒劑解除死藻毒性。

總之，控制藍綠藻的發生最根本的是平衡氮磷比例，合理施肥水，調整水產品，適時培育綠藻、硅藻等有益藻類，成為優勢藻種以抑制藍綠藻的生長，從而改變藍綠藻過度繁殖的狀況，達到控制藍綠藻暴發的目的。